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相关教师

个人资料

  • 直属机构：计算机科学与技术学院（软件学院）
  • 联系电话：
  • 性别：男
  • 电子邮箱：tfwu@suda.edu.cn, whutwutf@163.com
  • 专业技术职务：
  • 办公地址：理工楼545
  • 毕业院校：华中科技大学
  • 通讯地址：
  • 学位：工学博士
  • 邮编：
  • 学历：博士研究生
  • 传真：

个人简介

个人简介：个人简介：

吴庭芳，博士，副教授，硕士生导师。入选江苏省“双创博士”人才计划和苏州大学“优秀青年学者”。主持国家级项目2项，省部级项目3项。


研究方向包括AI4Science，生物医药大模型，智能计算等，近年来以第一作者/通讯作者在Nature Communications、IEEE TNNLS（中科院一区TOP 期刊， CCF B 类期刊）、IEEE TPDS（CCF A 类期刊）、 IEEE/ACM TCBB（CCF B 类期刊）、Information and Computation (CCF A 类期刊)，Information Sciences (中科院一区TOP 期刊，CCF B 类期刊)、IJNS（中科院一区TOP 期刊）、BIB（中科院二区TOP 期刊，CCF B 类期刊）、Bioinformatics（CCF B 类期刊）等期刊和会议发表论文40余篇。获国际膜计算学会（IMCS）学会2018年度最佳论文奖，入选IEEE 计算智能学会（IEEE CIS）Research Frontier。


在研究生培养方面，注重科研能力与学术素养的全面提升。每届研究生均以第一作者身份在CCF B类及以上或中科院二区以上期刊发表论文。硕士毕业生就业竞争力强：

2023届：周昳婷（三一重工）

2024届：靳智（美团，SP offer），王雪娇（苏小研），陈桃宁（中磊科技），

2025届：马旭豪（北京学科网）。

2020级本科生陈景尧同学从本科二年级进入课题组，并成功申请到卡内基梅隆大学继续深造。


目前计划招收2025级硕士研究生5名左右，名额充裕。欢迎对AI4Science、生物医药大模型、药物研发等方向感兴趣的同学联系：tfwu@suda.edu.cn 或 whutwutf@163.com。

同时也欢迎有一定专业基础的本科生加入课题组，参与科研项目与实践研究。

教育经历

教育经历：
  • 博士研究生（免试推荐硕博连读）,2013.09-2018.09,控制科学与工程,华中科技大学,工学博士,2018.09,控制科学与工程,华中科技大学
  • 本科,2009.09-2013.06,电气工程及其自动化,武汉理工大学,工学学士,2013.06,电气工程及其自动化,武汉理工大学

工作经历

工作经历：
  • 2021.08-至今,苏州大学计算机科学与技术学院,教学科研并重岗,副教授
  • 2019.04-2021.07,苏州大学计算机科学与技术学院,教学科研并重岗,讲师

社会职务

社会职务：社会职务：

  • 担任第19 届国际生物启发式计算理论与应用会议（The 19th International Conference on Bio-inspired Computing: Theories and Applications，BIC-TA 2024）程序委员会共同主席

  • 担任International Conference on Bio-inspired Computing: Theories and Applications （BIC-TA 2020~2024 ）、International Conference on Membrane Computing （CMC 2019~2024）等国际学术会议程序委员会委员

  • 担任华为云与计算先锋教师

个人简介

个人简介：个人简介：

吴庭芳，博士，副教授，硕士生导师。入选江苏省“双创博士”人才计划和苏州大学“优秀青年学者”。主持国家级项目2项，省部级项目3项。


研究方向包括AI4Science，生物医药大模型，智能计算等，近年来以第一作者/通讯作者在Nature Communications、IEEE TNNLS（中科院一区TOP 期刊， CCF B 类期刊）、IEEE TPDS（CCF A 类期刊）、 IEEE/ACM TCBB（CCF B 类期刊）、Information and Computation (CCF A 类期刊)，Information Sciences (中科院一区TOP 期刊，CCF B 类期刊)、IJNS（中科院一区TOP 期刊）、BIB（中科院二区TOP 期刊，CCF B 类期刊）、Bioinformatics（CCF B 类期刊）等期刊和会议发表论文40余篇。获国际膜计算学会（IMCS）学会2018年度最佳论文奖，入选IEEE 计算智能学会（IEEE CIS）Research Frontier。


在研究生培养方面，注重科研能力与学术素养的全面提升。每届研究生均以第一作者身份在CCF B类及以上或中科院二区以上期刊发表论文。硕士毕业生就业竞争力强：

2023届：周昳婷（三一重工）

2024届：靳智（美团，SP offer），王雪娇（苏小研），陈桃宁（中磊科技），

2025届：马旭豪（北京学科网）。

2020级本科生陈景尧同学从本科二年级进入课题组，并成功申请到卡内基梅隆大学继续深造。


目前计划招收2025级硕士研究生5名左右，名额充裕。欢迎对AI4Science、生物医药大模型、药物研发等方向感兴趣的同学联系：tfwu@suda.edu.cn 或 whutwutf@163.com。

同时也欢迎有一定专业基础的本科生加入课题组，参与科研项目与实践研究。

社会职务

社会职务：社会职务：

  • 担任第19 届国际生物启发式计算理论与应用会议（The 19th International Conference on Bio-inspired Computing: Theories and Applications，BIC-TA 2024）程序委员会共同主席

  • 担任International Conference on Bio-inspired Computing: Theories and Applications （BIC-TA 2020~2024 ）、International Conference on Membrane Computing （CMC 2019~2024）等国际学术会议程序委员会委员

  • 担任华为云与计算先锋教师

研究领域

研究领域：

  • AI4Science

  • 生物医药大模型

  • 药物研发


具体来说，主要利用大模型、计算机视觉、AIGC、分子动力学、知识图谱、自然语言处理等技术，解决生物医药中的关键问题。

开授课程

开授课程：
  • 1、算法设计与分析
  • 2、Java 程序设计
课程教学：

科研项目

科研项目：
  • 1、基于神经可塑性的脉冲神经膜系统及应用研究,2026/01-2029/12,国家自然科学基金面上项目,62572334,主持
  • 2、数值型脉冲神经膜系统及其学习算法研究,2021/01-2023/12,国家自然科学基金青年基金项目,62002251,主持
  • 3、数值型脉冲神经膜系统的计算性能及其学习算法研究,2020/07-2023/06,江苏省基础研究计划（自然科学基金）青年基金项目,BK20200856,主持
  • 4、自适应脉冲神经膜系统及其应用研究,2021/01-2022/12,江苏省“双创博士”人才计划,（2020）30763,主持

论文

论文：
  • 1、LABind: identifying protein binding ligand-aware sites via learning interactions between ligand and protein,Nature Communications (Nature 子刊),Zhijun Zhang#, Lijun Quan#,*, Junkai Wang, Liangchen Peng, Qiufeng Chen, Bei Zhang, Lexin Cao, Yelu Jiang, Geng Li, Liangpeng Nie, Tingfang Wu*, Qiang Lyu*, 2025, 16: 7712
  • 2、CAPLA: improved prediction of protein–ligand binding affinity by a deep learning approach based on a cross-attention mechanism,Bioinformatics (CCF B类期刊),Jin Zhi#, Tingfang Wu#,*, Taoning Chen, Deng Pan, Xuejiao Wang, Jingxin Xie, Lijun Quan, Qiang Lyu*,2023, 39(2): btad049
  • 3、DS-MVP: Identifying diseasespecific pathogenicity of missense variants by pre-training representation,Briefings in Bioinformatics (中科院二区TOP期刊, CCF B类期刊),Qiufeng Chen#, Lijun Quan#,*, Lexin Cao, Bei Zhang, Zhijun Zhang, Liangchen Peng, Junkai Wang, Yelu Jiang, Liangpeng Nie, Geng Li, Tingfang Wu*, Qiang Lyu*,2025, 26(2): bbaf119
  • 4、MetaMBP: Few-shot multi-label prediction of bioactive peptides based on deep metric meta-learning,Journal of Chemical Information and Modeling(中科院二区TOP期刊),Zhenglong Zhou#, Tingfang Wu#,*, Yelu Jiang, Geng Li, Liangpeng Nie, Jia Xu, Yi Zhang, Yiwei Chen, Lijun Quan, Qiang Lyu*,2025, 65(17): 9342-9360
  • 5、AACDR: Integrating Graph Isomorphism Networks and Asymmetric Adversarial Domain Adaptation for Cancer Drug Response Prediction,Journal of Chemical Information and Modeling (中科院二区TOP期刊),Yi Zhang#, Tingfang Wu#,*, Liangpeng Nie, Yelu Jiang, Geng Li, Jia Xu, Zhenglong Zhou, Yiwei Chen, Lijun Quan*, Qiang Lyu*,2025, 65(15): 8360-8374
  • 6、MMSol: Predicting Protein Solubility with an Antinoise Multimodal Deep Model,Journal of Chemical Information and Modeling(中科院二区TOP期刊),Jia Xu#, Tingfang Wu#,*, Yelu Jiang, Liangpeng Nie, Geng Li, Yi Zhang, Zhenglong Zhou, Yiwei Chen, Lijun Quan, Qiang Lyu*,2025, 65(13): 7238-7251
  • 7、RPEMHC: improved prediction of MHC-peptide binding affinity by a deep learning approach based on residue-residue pair encoding,Bioinformatics (CCF B类期刊),Xuejiao Wang#, Tingfang Wu#,*, Yelu Jiang, Taoning Chen, Deng Pan, Zhi Jin, Jingxin Xie, Lijun Quan, Qiang Lyu*,2024, 40(1): btad785
  • 8、Homogeneous spiking neural P systems with synaptic failure,Information and Computation (CCF A类期刊),Luping Zhang, Tingfang Wu*,2025, 304: 105281
  • 9、Spiking neural P systems with mute rules,Information and Computation (CCF A类期刊),Tingfang Wu, Luis Valencia-Cabrera, Mario J. Pérez-Jiménez, Linqiang Pan,2024, 299: 105179
  • 10、Spiking neural P systems with communication on request and mute rules,IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems (CCF A类期刊),Tingfang Wu, Linqiang Pan,2023, 34(2): 734-745
  • 11、Numerical spiking neural P systems,IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems (中科院一区TOP期刊，CCF B类期刊),Tingfang Wu, Linqiang Pan, Qiang Yu, Kay Chen Tan,2021, 32(6): 2443-2457
  • 12、Asynchronous spiking neural P systems with local synchronization of rules,Information Sciences (中科院一区TOP期刊, CCF B类期刊),Tingfang Wu, Luping Zhang, Qiang Lyu, Yu Jin,2022, 588: 1- 12
  • 13、On the tuning of the computation capability of spiking neural membrane systems with communication on request,International Journal of Neural Systems (中科院一区TOP期刊),Tingfang Wu, Ferrante Neri, Linqiang Pan,2022, 32(8): 2250037

科技成果

软件著作 软件著作：
  • 1、Spiking Neural P Systems: Theory, Applications and Implementations,2024,Springer Singapore
 专利 专利：

荣誉及奖励

荣誉及奖励：
  • 1、国际膜计算学会2018年度最佳论文奖,国际膜计算学会（IMCS）,2018
  • 2、江苏省“双创博士”,中共江苏省委组织部,2020
  • 3、苏州大学“优秀青年学者”,苏州大学,2020

招生信息

招生信息：

目前计划招收2025级硕士研究生5名左右，名额充裕。欢迎对AI4Science、生物医药大模型、药物研发等方向感兴趣的同学联系：tfwu@suda.edu.cn 或 whutwutf@163.com。


同时也欢迎有一定专业基础的本科生加入课题组，参与科研项目与实践研究。


 招生信息1：