复杂疾病的生物信息学与系统生物学研究：高通量数据分析（下一代测序数据、医学表型组学数据等）在癌症系统中的应用；疾病相关的重要生物网络的系统生物学模拟；microRNA的生物信息学研究；疾病相关蛋白质变异数据库和蛋白质功能位点的分析；基于组学和电子病历的大数据研究,转化医学信息学、健康管理与信息学等。
主要研究兴趣：整合生物医学数据，通过模式识别和系统建模，寻找疾病诊疗的生物标志物、健康管理与信息学
科研项目（2009～现在）
疾病相关氨基酸变异与生物功能关系的模型建立、软件开发与高通量计算分析（2009.1, 自然科学基金）
整合分析组学数据、寻找前列腺癌相关的microRNA调控模块（2011-2011，自然科学基金主任基金）
前列腺癌相关生物模块和通路的数据库构建及其功能分析 (2012-2015, 自然科学基金面上项目）
IL－1 a 在肝脏慢性炎症及肿瘤发生过程中的作用及其对机体免疫应答的影响（“非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制”重大研究计划培育项目，2011-2013）
白血病相关生物网络模块和反应通路的数据库构建与功能分析（2012-2014，博士点专项科研基金）
微小RNA在若干重要器官发育中的网络调控机理及其功能(2007.1, 973计划，微小RNA生物信息学与系统生物学)
组织干细胞的干性维持、分化控制和免疫调节研究 (2010.1, 973计划，生物信息学与系统生物学)
系统生物学专业研究生跨学科培养模式的实践与探索. （江苏省09年度研究生教育教学改革研究与实践重点课题）
蛋白质生物功能位点的生物信息学预测:算法与软件开发 (教育部留学人员回国基金, 2008)
系统生物学模式的新型肝癌智能诊疗技术 (苏州国际科技合作计划, 2012)
前列腺癌诊断、分级和预后相关的生物分子网络的构建和数学模拟（国家自然科学基金重大计划，培育项目，2012 ）
医疗信息集成融合技术与系统开发（<863计划>生物和医药技术领域“数字化医疗工程技术开发”重大项目，前列腺癌组学和临床数据融合，2013）
基于网络分析寻找前列腺癌相关microRNA生物标志物 （2015.1-2018.12, 国家自然科学基金）
帕金森病生物数据整合和分析（2016-2020,国家重点研发计划）
前列腺癌演变过程中的关键基因和模块及其作用机制（2017.1-2020.12, 国家自然科学基金）
复旦大学，1997-1999：统计力学
University of Tampere，Finland 2004-2008：R programming；Structural Bioinformatics，Microarray data analysis；Phylogenetics；Systems Biology
同济大学 2006-2007：Genome Informatics with Perl ；Proteome Informatics with R
苏州大学 2008～： 计算生物学与癌症系统生物学，免疫信息学与系统生物学；生物医学信息学
健康大数据研究;
推动健康大数据研究—系统生物学研究中心在斯普林格出版系列书籍
http://www.suda.edu.cn/suda_news/jxky/201709/725a2c6a-d463-47a9-ad61-a77f6cce108a.html
research ID：http://www.researcherid.com/rid/E-6431-2012
<span color:black;= style=box-sizing: border-box; margin: 0px; padding: 0px; border: 0px; line-height: 25px;>斯普林格出版系列书籍： 生物医学信息学与健康 :http://www.springer.com/cn/search?query=bairong+shen
近年来主要兴趣：
1）基于互联网+的医生、病人和医院三个层次的数据资源共享平台建设
2）前列腺癌症的Ｐ4医学
复杂疾病的生物信息学与系统生物学研究：高通量数据分析（下一代测序数据、医学表型组学数据等）在癌症系统中的应用；疾病相关的重要生物网络的系统生物学模拟；microRNA的生物信息学研究；疾病相关蛋白质变异数据库和蛋白质功能位点的分析；基于组学和电子病历的大数据研究,转化医学信息学、健康管理与信息学等。
主要研究兴趣：整合生物医学数据，通过模式识别和系统建模，寻找疾病诊疗的生物标志物、健康管理与信息学
科研项目（2009～现在）
疾病相关氨基酸变异与生物功能关系的模型建立、软件开发与高通量计算分析（2009.1, 自然科学基金）
整合分析组学数据、寻找前列腺癌相关的microRNA调控模块（2011-2011，自然科学基金主任基金）
前列腺癌相关生物模块和通路的数据库构建及其功能分析 (2012-2015, 自然科学基金面上项目）
IL－1 a 在肝脏慢性炎症及肿瘤发生过程中的作用及其对机体免疫应答的影响（“非可控性炎症恶性转化的调控网络及其分子机制”重大研究计划培育项目，2011-2013）
白血病相关生物网络模块和反应通路的数据库构建与功能分析（2012-2014，博士点专项科研基金）
微小RNA在若干重要器官发育中的网络调控机理及其功能(2007.1, 973计划，微小RNA生物信息学与系统生物学)
组织干细胞的干性维持、分化控制和免疫调节研究 (2010.1, 973计划，生物信息学与系统生物学)
系统生物学专业研究生跨学科培养模式的实践与探索. （江苏省09年度研究生教育教学改革研究与实践重点课题）
蛋白质生物功能位点的生物信息学预测:算法与软件开发 (教育部留学人员回国基金, 2008)
系统生物学模式的新型肝癌智能诊疗技术 (苏州国际科技合作计划, 2012)
前列腺癌诊断、分级和预后相关的生物分子网络的构建和数学模拟（国家自然科学基金重大计划，培育项目，2012 ）
医疗信息集成融合技术与系统开发（<863计划>生物和医药技术领域“数字化医疗工程技术开发”重大项目，前列腺癌组学和临床数据融合，2013）
基于网络分析寻找前列腺癌相关microRNA生物标志物 （2015.1-2018.12, 国家自然科学基金）
帕金森病生物数据整合和分析（2016-2020,国家重点研发计划）
前列腺癌演变过程中的关键基因和模块及其作用机制（2017.1-2020.12, 国家自然科学基金）
复旦大学，1997-1999：统计力学
University of Tampere，Finland 2004-2008：R programming；Structural Bioinformatics，Microarray data analysis；Phylogenetics；Systems Biology
同济大学 2006-2007：Genome Informatics with Perl ；Proteome Informatics with R
苏州大学 2008～： 计算生物学与癌症系统生物学，免疫信息学与系统生物学；生物医学信息学
健康大数据研究;
推动健康大数据研究—系统生物学研究中心在斯普林格出版系列书籍
http://www.suda.edu.cn/suda_news/jxky/201709/725a2c6a-d463-47a9-ad61-a77f6cce108a.html
research ID：http://www.researcherid.com/rid/E-6431-2012
<span color:black;= style=box-sizing: border-box; margin: 0px; padding: 0px; border: 0px; line-height: 25px;>斯普林格出版系列书籍： 生物医学信息学与健康 :http://www.springer.com/cn/search?query=bairong+shen
近年来主要兴趣：
1）基于互联网+的医生、病人和医院三个层次的数据资源共享平台建设
2）前列腺癌症的Ｐ4医学